穀笠合作社的年輕人為了推廣友善耕作，身體力行，也嘗試製作微生物堆肥。製作微生物堆肥，要先把所需材料米糠、雞糞、菌水、落葉準備好，然後盡可能將材料攪拌均勻，最後覆蓋落葉並重複此動作，便可靜待熟成。堆肥會因細菌的分解而發酵發熱，因此過程中要將堆肥攤平散熱，花的時間比較多，也需隨時觀察堆肥的熟成狀況，過程其實相當累人。 穀笠合作社的青農，是以手工翻攪堆肥，因此製作過程會發生人工作業的局限問題，例如堆肥味道不均勻，同一堆堆肥，有米糠與糖蜜香的區塊，也有輕微雞糞味道的區塊。製作完成的堆肥，質地若是細緻而成粉末散狀，才是好的堆肥。透過與在地農民的討論及學習，穀笠合作社做出400多公斤的堆肥，實屬不易。製作堆肥，對年輕人來說是初體驗，也是珍貴的習農過程。