埔里蜈蚣里蘊含豐富的水資源，有一條屬於區域排水系統的「墘溪」，貫穿著蜈蚣里東西方，它是眉溪流域分支，最終流至烏溪(大肚溪)，算是埔里鎮的上游溪流，提供重要農業灌溉水及附近好幾個里的民生用水。 墘溪涵蓋的水域廣大，流經板仔寮、石盤坑、鯉魚潭、蜈蚣，從大湳流至眉溪，經過青山橋、榮光橋、蜈蚣橋、大湳橋。「墘溪」因平時水源多在地面以下，表面上看起來沒什麼水而得名。墘溪屬於伏流溪流，又稱作暗流，有些河段水源多，有些河段卻沒甚麼水，平時會讓人誤以為很安全，但一遇梅雨季或颱風天雨量豐沛，地面下水源便會飽滿並流至表面，加上山地土石又多，嚴重時會造成土石流危害，導致淹水、橋墩崩塌。 蜈蚣里水源豐沛，其中公部門管理的墘溪第四自來水營運所，位於蜈蚣社區活動中心後方，主要提供蜈蚣里、大湳里、牛眠里、北安里、泰安里、北梅里、枇杷里七個里的民生用水，可見墘溪對埔里鎮用水的重要性。