靈應祠九丁榕據說原本長得一般高，約有25公尺，樹齡超過120年，民國七十五年韋恩颱風來襲，吹斷分枝，砸損了祠頂，還遇到了雷擊受損，主幹矮了一截，變成15公尺高。

民國100年8月，南瑪都颱風過境，並未帶來顯著的雨勢，卻吹著焚風，其中一株老樹經不起強風吹拂，樹幹從中斷裂，龐大枝幹壓毀一旁的鋼鐵棚架，所幸無人傷亡，虛驚一場，公所清潔隊緊急進行清除作業。

福田樹木基金會樹醫師曾經來探望這兩棵九丁榕，指其中一棵樹幹真空化、腐朽的相當嚴重，白蟻入侵，並且有寄生植物寄生，情況相當危急。

但因當時欠缺相關救治經費，且棲地所有權不易釐清，因此救治行動並未落實，隨時有倒伏的風險，目前廟方已用封鎖線將樹木圍住，建議民眾賞樹時物靠得太近，以免發生危險。