全教會、全教總對攸關未來教育發展的十二年國教方案，除於去年1月成立12年國民基本教育因應小組（至今召開十次會議），並有以下努力方向：
一、強力訴求「私校公共化」
本會十二年國教小組更具體決議「反對直升，支持社區就近入學」、「接受免學費或高中職優質化經費補助之私校，其免試入學比例不得低於所屬免試就學區當年度免試比例。」
二、「代收代辦費」合理收費
本會代表與會訴求下已有具體決議，包括101學年開始「不收網路費」、「電腦實習（使用）費只能針對一般科目收取」、「冷氣電費採用獨立電表以度計價、專科教室不向學生收費」、「合理調整實習實驗費」。
三、高中職教育精緻化
全教會於2011年12月28日，針對佔全國四成校數的完全中學資源不足問題開記者會。教育部回應完全中學設立將訂定基準、通盤檢討，並優先核撥補助經費，改善教學環境及設備。
並已列入近日與教育部座談優先訴求議題積極爭取，「課程鬆綁」與「大學、技專入學方式」也將列為下一波工作重點。