中華民國全國教師會（簡稱全教會）依據教育部2010年5月7日台國（四）字第0990079030號函，於2010年5月18日以九九全教政字第99301號函，以最速件函知教育部，全教會反對課稅案變更配套內容。並以副本函送行政院、教育部部長辦公室、教育部陳益興次長辦公室，及全教會所屬各縣市教師會、理監事、會員代表。說明大略為，對於教育部2010年4月28日函送行政院課稅配套前，多次由部長或次長邀全教會代表洽商，積極尋求共識之態度，全教會表示感謝。而全教會對於課稅案的立場，詳細內容就如本函檢附的該會2010年5月10日「支持取消軍教免稅，改善教育環境之原配套務必到位」新聞稿，也就是反對變更原配套金額為72億。若無法確實依據原協商完成之配套金額執行，則全教會主張應提高國小編制至2.0、國中至2.5，或與軍教取消免稅配套做法一致。