金包里慈護宮相傳創建於清嘉慶十四年（1809），最早由先賢黃士進捐獻廟地，地方士紳募款興築而成。金包里地區媽祖廟舊址位於現廟附近之停車場地區上，所供奉媽祖為現今慈護宮內所供奉之「大媽」。 後來，居民在野柳海邊的岩洞（今尊稱為「媽祖洞」）中發現一尊媽祖像，當地居民不忍媽祖像無處可歸，便決定將其移至廟中接受供奉，即選中位於野柳地區附近的金山地區蓋廟奉祀。慈護宮興建完成後，請原先金包里中的「大媽」入廟，再請從野柳來的「二媽」入廟，接受奉祀。 現廟的規模有二進，分別為前殿與正殿，兩殿之間用天井與廊道相連，格局精巧，建築特色經初步了解可知，大木匠師陳應彬一派在日治時期明治三十二年（1899）時曾主持過慈護宮的整修工程，因而慈護宮的大木結構可看出帶有漳派的風格。