日治時期，因為禁止出草，後來這些首級被集中埋藏，並立有一「ボンガリ(望嘉社)頭骨塚」石碑。昔日設於舊社外西南方約200公尺處，進入舊社路徑旁之頭骨架，是歷史相當悠久的一座古老頭骨塚，據日治時期田調清查資料顯示，望嘉舊社之人頭骨架為全台蕃族各社頭骨架中最大且最驚人之頭骨塚，據1930年代日學者測繪，石垣室構造物高約1.5公尺，進深約3.5公尺，疊砌成長約9.8公尺。堆疊石板成井字形的眾多方形空隙，塞著四、五百個以上的乾枯頭骨。