陳氏小宗宗祠俗稱「東祖厝」，屬西間房派，興建於清末。因該房派族親旅居南洋而事業有成者諸多，乃於民國19年（1930）由旅居南洋族親籌資，將原二落大厝改建為二樓西式洋樓小宗祠。民國38年（1949）宗祠被軍隊佔用，最初作辦公室，後則為訓練班講堂。後戰地政務解除，民國70年（1981）軍隊撤出，因宗祠多處損壞，民國78年（1989）碧山陳氏宗親籌資修葺宗祠，每丁出資新台幣四千元進行整建，目前所見宗祠樣貌，便是此次整建之結果。 有關碧山陳氏之源流，據《碧山陳氏宗祠重修誌》記載： 「先祖原係河南光州固始籍，支分福建泉州晉江縣深滬鄉，始祖德宗公，仕元官，居一品平章事，以剛直建言，於朝被禍，其三子在家聞訊，乘舟泛海而逃，中流遇風散，開基祖存仁居次，帶妻柳氏遇風飄至金門後山鄉海邊，登岸擇地，因世居焉。蓋深滬前臨海，背有後山與碧山峰，祖乃五房派下，因不忘本而沿用後山與碧山，其名之由來也。」 陳氏先祖陳德宗祖籍福建晉江深滬後山鄉，而於唐高宗總章年間，陳政父子奉敕入閩平叛，其子陳元光被譽為「開漳聖王」，此為「將軍派」，是為福建陳姓主要支派之一。「滬江」及「將軍」為後人碧山陳氏源出及其所屬支派，於宗祠楹聯中皆可見。 碧山陳氏開基祖陳存仁舉家遷居來此地後，總共生了五個兒子，其中老大、老二及老五為庶出，嫡出者為老三、老四。此五房後以居住地區分成：西間長房、東間二房、中央三房、門口四房及溪墘五房。西間房奪長，故尊稱謂大舍公，碧山陳氏小宗宗祠便是西間房裔孫所建。