永基圳於雍正年間（1723-1734年）開掘，由彰化吳阿塗經營，接著由竹塘詹春水、許米、邱玉中、吳夢龍、詹國、詹桂芳、曾慶等人依次管理。直到日治時代，明治34年(1901)永基圳與其他大圳均納入「臺灣公共埤圳」，受「臺灣公共埤圳規則1」16條和「臺灣公共埤圳規則施行規則」28條等法規規管，由行政官廳監督管理。由圖一便能看到永基圳當時大致的範圍。 大正元年(1912)北斗水利組合與虎尾水利組發生分水爭議，永基圳也被劃入分水協議之中。分水是為了解決枯水期沒有水使用而造成的衝突。大正12年(1923)臺中州廳將永基圳、深耕圳、莿仔埤圳等公共埤圳合併設立「北斗水利組合」。 直到集集攔河堰建成之前，永基圳的源頭來在溪州鄉潮洋厝引濁水溪水。而集集攔河堰建成後，永基圳的水源則是來源於莿仔埤圳，從溪州鄉寮村陸軍路的莿仔埤圳第三制水門取水。永基圳還有二圳和三圳，而水源是由永基圳經水尾堤防供給。三圳則由二圳供給，形成一個系統。