第一賓館為日治時期日軍所建。民國38年5月17日已下野的蔣中正總統首次下榻於此。爾後國民政府遷台，蔣中正總統及蔣經國總統、李登輝總統抵澎巡視時，都曾多次下榻此處。民國47年「八二三」砲戰時，蔣中正總統坐鎮賓館成立指揮所，有其重大歷史意義。為日式建築物，結構為承重牆，木桁架、文化瓦屋頂，由於軍方長期管理維護，且甚少開放參觀，現況保存良好。建築面積約五五○平方公尺。賓館為蔣中正總統等駐蹕所在，是澎湖地區少數融合「和洋」混合風格之代表特例之一，其內部雖曾修改，但保存良好。賓館兼任作戰指揮所，是今留存之行館當中唯一具有戰略設施者，且設備完整，具有充分而豐富之人文、歷史、軍事意義，極具保存價值。縣政府為整修第一賓館並恢復原有空間形式，民國90 (2001)年委由樹德科技大學做調查研究暨修護計畫，並於民國93年委由徐裕健建築師做修護規畫設計，由長太營造廠承包修護。 民國98年整修工程完工後，近年開始透過小型修繕工程，維持管理維護計畫執行方向，約民國105年發現，屋頂屋面板有水漬，另民國40~50年增建的鋼筋混凝土書房、廊道、餐廳、蔣經國總統房間有鋼筋爆裂現象，另所有對外木製門扇剝漆、戶外庭園燈具損壞及地下指揮所下雨積水等嚴重問題，於民國113年完成修復工程(設計監造為玉騰建築師事務所、承攬廠商為和勝營造有限公司)。