陳有蘭溪為濁水溪最長的支流，其發源於八通關古道上的金門峒，最初由東南向西北流，匯聚在沙里仙溪和社溪後，河流流向改為由南向，最後匯入濁水溪。而陳有蘭溪集水區流域呈現狹長型，主流由南向北，在水里一帶注入濁水溪；支流分別由東、西兩側山地平行注入主流。其西岸最主要兩大支流為社溪和沙裡仙溪。東岸以郡坑溪、十八重溪規模較大。由於此處地質容易崩落，再加上山坡陡峭，造成陳有蘭溪有明顯向源侵蝕現象，導致溪水中泥沙懸浮量甚高，砂土沉積情形明顯。 　　陳有蘭溪上游原由南投縣政府管轄，在歷經1998年、2000年兩次變革，治理權責由經濟部水利署接管，目前由第四河川局負責陳有蘭溪與沙里仙溪匯流口以下河段之河川治理工作。陳有蘭溪的集水區經過賀伯颱風、921地震、桃芝颱風等災害侵襲，崩塌情形甚為嚴重，土砂輸出量甚大，造成中、下游河床逐漸淤積，河床抬升。現有多處的堤防在泥沙大量淤積下，堤防高度已不符合現今防洪標準，因此河道兩旁的農田、聚落有潛在的洪患危機。