風神廟之歷史脈絡可追溯於1739年（清乾隆四年），主祀風神爺，興建於南河港沿岸，與峴石亭、棠蔭亭為一體的古蹟建築，為早期文武百官來往臺廈之重要出入口。 根據傳說，風神擁有掌管風的能力，供航海業者和貿易商祈求風調雨順、航海平安，可說是當時的地方核心，是全臺唯一主祀風神的廟宇。 古代祭祀風雨雷師見於周官，唐宋時期始增加雨師和雷師的祭祀，明代則將風雨雷師合祀於太歲月將壇。清代初期，將風雲雷雨、山川、城隍共祀一壇，每歲春秋仲月致祭。1765年（清乾隆三十年）和1777年（清乾隆四十二年）分別經歷兩次重修，並新增建官廳、馬頭、石坊。 而隨著時代交替，如今之風神廟由於日治時期之道路開闢而有所改變，原殿內神像移置官廳供奉，整個風神廟及接官亭亦被道路分割為二。為使風神廟之文化意義長存，地方人士將其於原門廳位置重新建造一三合院格局之廟宇，保留了獨特的建築特色與歷史意義流傳至今。