同治12年（西元1873年）彰化白沙書院院長蔡德芳、拔貢生林清源採訪中部節孝婦女名單，共採訪到120名節孝婦女事蹟。光緒12年（西元1886年）由進士蔡德芳、丁壽泉、貢生吳德功、訓導劉鳳翔等人再採訪160名節婦事蹟，經由臺灣府知府程起鴞、彰化知縣李嘉棠等奏請禮部，光緒13年（西元1887年）准予立祠，正式編入官方祀典，經進士蔡德芳，吳德功的倡建，擇址位於城隍廟東側建節孝祠，至光緒14年（西元1888年）完成。 明治28年（西元1895年）日軍與抗日義軍發生大規模之會戰，彰化城陷，節孝祠在這次事變中祠中的木龕及前後門扇遭到嚴重毀損，幾經風雨剝蝕，廟宇依然無恙，然而所供之眾多牌位卻因戰火洗劫而蕩然無存。吳德功乃於明治13年（西元1900年）呈請彰化廳長須田綱鑑將縣誌節孝及同治、光緒年間送請表旌的節孝姓氏，登諸神牌。日治時期因市區改正，節孝祠遭拆除，後經地方士紳吳德功，商紳楊吉臣、吳鸞旂等董事，向總督府申請，以彰化公園一角地作為遷建地址，吳德功之弟吳汝俊、侄吳上花，並邀請鹿港士紳陳懷澄等人參與遷建工程，並募款八千圓資金，將節孝祠遷建於現址。 大正12年（西元1923年）完成節孝祠的遷建，臺灣總督田健治郎及臺中知事常吉德壽重新表彰自明治28年（西元1895年）以來，至大正12年（西元1923年）已故及現存節孝、貞烈婦女112人，合計前朝共390餘人，合祀於節孝祠。民國34年（西元1945年）起，節孝祠不再接受入祀，因此不若一般寺廟有旺盛之香火，後由吳德功之後人組織財團法人負責管理，定期舉行春秋祭典。在民國74年（西元1985年）經內政部公告為第三級古蹟，民國82年（西元1993年）曾執行修復工程，民國86年（西元1997年）<<文化資產保存法>>修訂後指定為縣定古蹟，民國88年（西元1999年）因九二一大地震導致圍牆倒塌拆除，遂進行二期工程施工修復，並於民國91年（西元2002年）修復完成。