曹公圳總共有五大圳，流經原生植物園的這一條是曹公新圳中的菜公圳體系中的洲仔洋瓣圳。舊時，曹公圳的水流進入鳳山縣城時，除了具備灌溉用途之外，還可以當作護城河。當時，洲仔洋瓣圳是曹公新圳的主要幹道，下游的圳道到現在仍在使用，部分圳道在高鐵路中央的分隔島，往南流到原生植物園後，再注入蓮池潭。 在面臨都市發展的情況下，曹公圳的灌溉面積已由當初的一萬三千公頃縮減為不足六千公頃，圳道本身也受到壓縮而逐漸消失、地下化。洲仔洋瓣圳如同高雄許多地方，在幾十年前重視工業發展的情況下，慢慢變得雜草叢生，像是廢棄的水溝。後來在原生植物園設計時，特別使用生態工法規劃、建構，重建生態系統。現在，經過整治之後，已經有各種魚類悠游其中，蝌蚪或其他水棲動物、植物，也都慢慢出現，呈現出多樣的生態世界。