臺灣的地形主要是由板塊運動所形成，臺灣南部地區，尤其是恆春半島地區，多屬於珊瑚礁海岸地形。 依照珊瑚礁所處的位置，還可以區分為隆起珊瑚礁、海岸珊瑚礁及現生珊瑚礁。隆起珊瑚礁形成於千百萬年前，因為地殼變動的影響，離開海面，上升百公尺的高度，高雄柴山就是屬於由珊瑚礁組成的地區。海岸珊瑚礁是分布在海水面上約10公尺高度的地方。海岸珊瑚礁的林相自成一格，是高雄特殊而珍貴的「季風雨林」生態。 原生植物園當中的珊瑚礁生態區，就是模擬海洋的縮體，以珊瑚礁為立地的基礎，依照由海邊到內陸，依順序呈現沙灘、臨海珊瑚礁、海岸灌叢、隆起珊瑚礁及礁間平台等臺灣原生環境的地質、地貌和植物生態的特性，就像是在呈現生態剖面圖一樣，完整地呈現高雄特有的季風雨林生態圈。