民國35年（1946年）芎林國民學校在臺灣光復後，重新設計的新校徽，以區別日治時期第一代與第二代校徽。

旗徽左右有翅膀狀長短三色（青白紅），與中華民國國旗同色，均有白色框線，往內位置有三片稻葉，與芎林當地農業連結，中間為合併上下箭頭設計，顏色為內黃底外紅框設計，「芎」字為紅色楷書字體，校徽頂端有三個白點，新校徽沿用至民國88年。此紫底大橫幅為彩緞，掛於禮堂講台上方，左書「光復後第十三屆畢業生敬贈」，右書「母校惠存」，現況保存良好。