柑仔林為平埔族新港社移居地之一，1877年馬雅各醫生到此地進行醫療傳教，後設立柑仔林（Kamana）長老教會，為木柵教會支會，但因地形關係容易淹水，在馬雅各醫生和李庥牧師的協助下，1899年遷往地勢較高的韭菜崙，改名為溝坪教會，後因禮拜堂漏水等原因，又於1937年遷於現址，1947年改稱為永興教會。1871年湯姆生一行在柑仔林（Kamana）停留休息，並在Tong的引導下離開了禮拜堂。