臺灣府為清代臺灣的行政機關，為1684年至1885年設於現今臺南一帶。主要為臺南自鄭氏王國以來，即為臺灣人口、經濟的中心，因此多處政府機關及設施皆設於臺灣府內。最初並無築城，僅以木柵、刺竹為防禦措施，1788年林爽文事件後，改為土城，至1885年臺灣建省，改為臺南府。
湯姆生一行人前往臺灣府拜訪當時的道台黎兆棠，告知前往山區的目的，僅是為了進入島的中心看看原住民。道臺及其友人難以理解為什麼湯姆生一行人要自找麻煩地用雙腳長途跋涉，去一個連明確的道路都沒有的地方，只是為了看看那裡，還要冒著可能會喪命的風險。湯姆生於臺灣府所拍攝的照片，收藏於英國威爾康圖書館（Wellcome Library ），典藏編號為L0056045、 L0055945、 L0055943。另，部分照片也收錄於李仙得的《臺灣紀行》（Notes of travel in Formosa）。
