戰後新竹靈隱寺辦學史，源自無上法師對僧教育的認同，他曾先後多次邀請來自中國大陸的僧人到靈隱寺辦學。從1949年慈航法師創辦靈隱寺佛學院，1951年大醒法師開辦「臺灣佛教講習會」，到1958年續明法師主持「新竹靈隱寺佛學院」，1961年廣化法師辦第二屆靈隱佛學院，1969年聖法法師續辦佛學院，但都因人事不合而只是曇花一現。為什麼靈隱寺辦學，不是延續不斷的辦，而是常常間斷？主要受制於當時戰後臺灣白色恐怖政治的整個大環境，也和無上法師住持的小環境（靈隱寺）內部人事紛爭有關，無上法師與鄭保真的師生關係，使得靈隱寺無法「擺脫」鄭保真的干擾，此對靈隱寺佛學院的辦學成效，甚具殺傷力。戰後新竹靈隱寺一頁辦學滄桑史，真是「好事多磨」、「多災多難」。這段辦學滄桑史起自無上法師，整個過程中，雖時有間斷，但很難說它是完全失敗的。就靈隱寺辦學精神而言，其為「僧教育著想」的理念，與近代佛教改革大家-太虛大師完全吻合。