旗後礮臺紅磚從廈門運來及花崗岩在碼頭卸下，且可能以人工搬運至旗後山上，施做之工匠應雇自漳、泉州匠師，對於紅磚堆砌工法考究，有磚刻及花式砌法。

旗後礮臺所用的磚匠是擅長藝術表現的一群匠師，工匠發揮專業在階梯地磚、城內的牆面上做了許多不同的花樣及花紋排列及砌法。

在入口大門上砌出兩邊寫法不同的雙「囍」字形，內部中央川廊兩側牆面亦有數種頗為豐富變化的花式砌法，各階梯更是砌成不同樣式的圖案，且每個階梯樣式不一樣，表現意思也不一樣，整個礮臺磚的形式非常多樣化；現場可以見到磚的排法有入字形象，也是傳統中國庭院極為常見為進入之意思、另一階梯磚排法為丁字，其他階梯排法也有八卦形式及十字型組合或六角磚型式、文字形象排列之階梯、花朵型式階梯磚、圓形圖案排列階梯磚等，非常之豐富。

於清末曾有美國記者Jame W.Davidos撰寫之「臺灣的過去與現在」一書中，曾記載「在打狗旗後山地方之下端亦構築一砲台，其設計原為歐式，後又參酌華式而成者」。