馬祖民營汽車行自1969年（民國58年）7月開始籌備，除輔導外，並投資五分之一，於1970年4月宣告成立，於同年8月10日開始營業。首期經營至1970年底，計有貨運車三部、客運車一部，由於創始初期，缺乏經驗，車輛又復太少，不敷調度，兼以車輛程式不適本地區地形情況，經常因修理停駛，影響收入，更未確實計算成本，所訂收費標準過低，以致虧損甚多，經股東會議決定改組，並鑒於地區需要運輸之物資有限，運輸頻率過低，亟需接辦地區客運交通車，於1971年6月1日正式接辦客運業務，有五位女車掌曹金華、翁玉珍、朱碧玉、劉品金等隨車服務，原由軍中支援的便民交通車亦結束任務同時停駛。 於1971年5月19日由司令官兼主任委員主持的協調會中協議事項包括：為兼顧汽車行成本及軍民乘車負擔，經奉司令官兼主任委員核定後的貨運收費，一噸半車，東區（為福沃、青潭、梅石、復興、清水、介壽）七十五元，中區（為梅石以西，仁愛以東）八十元，西區（為津沙、仁愛、珠螺、馬祖）九十元。二噸半車，東區九十元，中區九十五元，西區一百元。客運票價四元，軍警二元。 另有四項協議：一、民營貨車在補給船隻疏運及高級長官離開後，可以進入港口，但必須接受港管站之管制與協調。二、防衛部及各部隊傳令憑傳令證章可免票搭交通車 （俟協調由防衛部勤設組草擬辦法令頒實施）。三，撕票稽核等要注意，以免重用或漏票，四、沿途遮蔽車路之樹枝可整修，又梅石總統銅像右側下坡這曲半徑太小，試車時勘察改善。