依據《連江縣志》之〈經濟財稅志〉所載，馬祖物資供應處最早的為物資調節處，1956年7月馬祖開始實施戰地政務，轉由聯勤經營，更名聯勤馬祖地區物資供應處。 1963年改隸馬祖戰地政務委員會，更名馬祖戰地政務委員會物資供應處，負責馬祖之民生物資供應，及戰備物資囤儲調節。 戰地政務時期，馬祖及東引物資供應處負責平抑物價、調節供需、戰備存糧及統籌財政等任務，其業務如下：

一、物資供應：採管制與開放並行，重要民生物質為統購物資、其餘物資鼓勵商人申請採購證自行進口，管制物資均屬較為重要之民生物資，解嚴後，除臺灣菸酒、汽油、柴油仍由該處代售外，其餘物資開放民間自行進口，或輔導鄉親集資經營。 

二、物資代銷：代銷馬祖酒廠各式酒類。 

三、物資配銷：物資供應售價制定，呈報馬祖政委會核准實施，戰地終止後，由該處呈報連江縣政府。

四、物資申購：訂定年度及近三月銷售規劃，檢討庫存與代運量。戰地政務時期，委請陸軍外島服務處負責在臺採購、監驗、運輸。戰地政務終止後，如遇急需，得以傳真方式向貸售機關辦理增貸。 

五、物資儲運：民糧由各村囤儲外，其他如黃豆油、砂糖、臺灣菸酒、塊煤、火柴、煤油、柴油等由該處及分處分別囤儲。 

六、油品供應。 

七、會計業務。

1992年11月戰地政務結束，全面開放商品輸入。馬祖物資供應處及東引物資供應處所屬各單位，移交福建省連江縣政府，合併更名福建省連江縣物資供銷處。2002年8月，縣議會通過「連江縣政府組織自治條例修正案」，物資供應處為裁撤單位之一，2002年12月19日，連江縣物資供銷處完成最後一次北竿送貨到家服務，結束營業，馬祖物資供銷處走入歷史。