1957年，馬祖初級中學創立；1968年延長國民義務教育，連江縣劃分四個學區，南竿、北竿、莒光及東引島各設國中一所，原初級中學升格為福建省立馬祖高級中學。1984 年，馬祖高級中學升格為國立馬祖高級中學。 現今的馬祖高中校歌作於馬祖初級中學時期，由魏鈞作詞，葉紹平作曲。據陳儀宇於2013年12月16日於馬祖資訊網發表〈揚帆50年，鄉關故處總相隨──故鄉馬祖，母校馬中，校歌軼事〉一文，回憶此校歌為任教於馬祖初中的魏鈞老師，於接任其導師那年（陳儀宇於民國49年初秋入學），有鑑於當時校歌尚付闕如，即以馬祖漁鄉、戰地、古風民情、教育文化等元素撰為歌詞，並請友人譜曲，而傳唱至今。 「國立馬祖高級中學校歌」歌詞：「山為屏障，海是魚倉，這是馬祖青年的搖籃；這是漁民子弟的溫床。風雨咆哮，海浪呼嘯，我們在戰雲中茁壯，我們在烽火中成長，以文武合一作準繩，以德智體群為教養；繼承民族文化，接受科學新方，實行三民主義，建立復國基牆。師生一體，甘苦共嚐，同心發揚馬祖精神。立志要做國家棟樑。同舟共濟，弦歌一堂，願我莘莘學子，永為母校爭光。」 此圖取自連江縣政府出版《煙硝下的教化記憶》(陳春梅，2005) 一書。