大花廳的戲臺的正上方藻井，雕有一朵極精緻的大牡丹，富貴華麗、氣派非凡。一般寺廟中所見藻井，通常位於三川殿，在特定場合充為戲臺空間，可以知道古代戲臺通常會有藻井，常見的藻井形式有八角形結網、四方形結網和旋渦形結網。原始的功能是為了支撐天窗，由中間向兩側以斗拱榫接逐漸往外延伸，將整個屋頂的重量分散到周邊的柱子。藻井也有近似吸音牆的功能，降低表演時反射的回音。然而大花廳戲臺的藻井與一般常見的藻井形制相當不同，最外層為八角形，但內側係採圓形疊澀的方式向上收攏。外圍兩層的斗拱形式較近於裝飾意味，非實際承重之用。從藻井中央倒置的牡丹向四方放射出去的肋拱，為大花廳戲臺特殊的設計，是臺灣少見的藻井造形，為福州風格的藻井樣式。