「乾溪」發源於南投縣火炎山，上游的南坑、北坑在峰谷二號橋雙溪口會合後，流經峰谷村、北柳村，匯入草湖溪。乾溪有個特殊的河流段，地質是頁岩、砂質頁岩、泥岩所構成，區域大約是從北坑的石門到峰谷村一帶，在這個河段裡面的地質構造形成於上新世，時間大約在七百萬年前。從岩層的分布可以知道，此段的原本是位於海底的「階地堆積層」，在海洋裡的有機或無機物層層堆積後，成為岩層結構的雛形。後來經過斷層的擠壓上升，離開海底，成為陸地的一部份。 乾溪上游發現的生物化石非常豐富，有海膽、牡蠣、螺貝類等化石，許多石頭上布滿密密麻麻的貝殼化石，其中以扇貝化石最多，據此推斷乾溪以前在海底。之後因為菲律賓海板塊與歐亞板塊擠壓的造山運動，地層因受推擠而隆起，再經河水不斷的侵蝕，地層裡的化石終於露出地表。