明治28年（1895），日本皇族的北白川宮能久親王，奉明治天皇之命率領近衛師團來臺接收，在進入臺南城後，暫時借宿臺南府城富商吳汝祥之宅邸。同年10月28日，北白川宮能久親王病逝於宅第側邊廂房。明治33年（1900），日本政府將北白川宮能久親王薨去前的寢殿作為「御遺跡所」，寢殿遺跡所內保留其使用過的「御寢室」、「御寢臺」、「御寢具」、「御單架」以及當時攜帶的軍用鞋。日後，殖民政府將親王神格化，在御遺跡所旁建臺南神社，屬官幣中社，是主祭北白川宮能久親王之神社，戰後廢社，現已拆除。