石門自古即為進入牡丹社與高士佛社的重要關卡。清同治10年（1871），琉球藩民五十四人遭高士佛社蕃人殺害；同治13年（1874），日本以琉球宗主國自居，用「保民義舉」與清國談判，並以此為藉口出兵臺灣，由西鄉從道率領軍隊於該年五月在射寮海岸登陸，攻擊以牡丹社為主的原住民部落，隨後在龜山駐紮。沿四重溪河谷對原住民進行游擊式戰術，而牡丹社和高士佛社則於此盤據石門天險，奮力抵抗，此石門古戰場即昔時日軍與原住民激戰之地。