第一劇場。水戶黃門與助，格三人救了剛要投水自殺的訂屋辰之助，他是大阪富豪定屋辰五郎之子，黃門問其故，知道辰五郎死後，向定屋借款的諸侯，乘機辰之助生意外行，不還債務尤其神戶之本多伊予守與定屋經理通謀，侵佔其財產，並從大阪將辰之助驅逐出境，辰想東山再起，投資於新興的蓮華教，但終因騙局，身無分文，乃厭世尋死。黃門用計，臨時湊集許多流浪漢，充作臨時隨從，進入神戶城，他先使眾臣喪膽，後詰問伊予守迫伊向辰還債，且使其將年賦之半，還給人民。黃門一行離開神戶，在一小旅社救出了被老闆虐待的明叫敬太郎與妙之兄弟，他們正在探訪母親與姐姐，而旅行來到此地者，蓋其母親偕女兒雪，因侵信蓮華教，往伊勢，極樂島就醫，至今行蹤不明，黃門乃懷疑蓮華教之真相，即急往極樂島，在蓮華教的寺廟內黃門眼見尋找女兒而狂喊的老人，及聽到敬兄妹說，美貌的教祖就是其姐姐雪無疑，故他判斷蓮華教為一邪教，決意刺探內情，果然教祖就是雪它與患病之母親來本島，但母親被惡棍淵大全坊所殺，他本身卻被大全坊強迫扮裝教祖的魁儡。是夜敬、妙與雪相會，但被大全坊發見，被禁在地窖裡，地窖下之小灣內住著很多吃人的沙魚，同時候，黃門帶著助、格進入蓮華殿內調查，在後園內，碰見阿蝶，她本來在犬山城學習作女服侍，但不習慣，且因思戀助，乃逃出追來者，她來到鳥羽，遇見和尚出身的壞蛋長崎東次，知他即是大全坊，一面受其引誘，一面欲查明邪教之內部，乃加入教團做信徒。黃門欲將奸賊一網打盡，但顧慮民心之動搖，決定先暴露蓮華往生之謎，翌日蝶設法使雪與敬，妙堅持一歸同盡，敬與妙使得逃出虎口，黃門命蝶揹兄妹乘秘密小舟往鳥羽報緊，請其派救兵，是日，助假裝瘋癡，大鬧大闖後，被關入蓮華台，果然台下有拿著真槍的嘍囉，準備刺死他，助奪其槍，暴露蓮華往生便是殺人機關，大全坊驚慌，指揮眾嘍囉，大打武行，他認滅亡已到自毀巨像，以手槍，把黃門逼入地窖中，其時鳥羽官兵趕到，邪教團全部就逮，大全坊亦反為雪擊斃，落入深淵，稻垣攝津守亦由忘信清醒起來，早晨太陽照耀著，好似祝福和平之來臨與黃門一行之成功。