現代的金唐殿，仍然典藏了南部諸多宗教藝術名工，如王石發的剪粘、施天福的石雕。往前的時候，此處還有潘春源的門神彩繪，乃至「南何北洪」之一的何金龍所作剪粘。 雖然數代以後，由於經歷改建或整修等工程，一些名家作品已經被掩埋在廟史之中，然仍不失金唐殿本身藏品豐富的性質。 

佳里此地，原本有座此鄉蕭瓏社西拉雅族的公廨。至於明末時期，才逐漸有漢人前來開墾，並建立草寮小廟，是為金唐殿之濫觴。

後來至清康熙年間，由於有王船自海上漂流至此，當地人以為是代天巡狩的王爺顯聖，虔誠供奉，並按旨意至台南歸仁大人廟代天府，請來三位王爺香火。 由於是金唐殿王爺是玉帝所敕代天巡狩，故時稱玉敕。後來於林爽文民變一事，金唐殿協助官方平亂有功，為乾隆皇帝御賜恩榮，受有旌義匾與下馬碑等寶物。故成為了台灣極為罕見的可冠玉敕、皇敕名銜的廟宇。 

在金唐殿中流傳的，除了它輝煌的歷史以外，更有著葉王、何金龍、王石發、王保原一脈匠師，代代皆為金唐殿留下藝術作品的佳話。至今金唐殿虎門內的墻堵上，更有一小方瓷片，詳細記載了葉王一脈匠師在金唐殿中的「換代」記錄。