從1945年第二次世界大戰結束至今，新莊武聖廟興修數次。在1948年新莊武聖廟完工，廟貌恢復原有的舊觀；於1949年組織管理委員會，可惜功能不彰、形同虛設。二二八事變前後，軍隊駐進，廟宇荒廢、古蹟遭受破壞殆盡，不少古物及廟貌都遭受嚴重的損壞。1957年，新莊人士再次倡議重修新莊武聖廟，獲得熱烈支持迴響，1979年，以現代鋼筋水泥與工法全面翻修武聖廟的前殿，屋頂改為重簷歇山的假四垂。1985年新莊武聖廟被內政部列為國家三級古蹟。1993年，廟宇毀損嚴重，所以在1995年起，臺北縣政府乃進行古蹟維護籌備工作。1996年委託徐裕健建築師事務所進行古蹟保存修護研究工作。1999年，新莊武聖廟在「九二一集集大地震」受創嚴重，根據內部政災後統計資料，經外觀綜合判定為「有立即性危險」，所以開始修復及新建工程。重修後殿及興建三層樓廟宇建築，於2002年完成安座儀式。