進入新莊文昌祠的山門，經過贔屭石、廟埕之後，即可看到三川門。與多數的廟宇一樣，廟方於三川門前即放置有祭拜順序的說明立牌。 信眾由面對廟門右手邊的龍門，仗祥龍之勢，納祥瑞之氣進入文昌祠的正殿，首先面朝三川門外，在天公爐之前向天祝禱，祭拜天公。 然後依序到大殿祭拜文昌帝君、歷代聖賢、魁斗星君，然後到瘟祖殿、財神殿、祿馬殿、月老殿祭拜。 最後由三川門的虎門仗猛虎之威，降邪化煞而出。 廟宇神殿的設計及神明之間，均有尊卑之分，因此拜拜的順序也必須按照由尊至卑的順序。以台灣的民間信仰而言，代表玉皇大帝的天公爐位階最高，所以首先參拜的是天公，向天祝禱後將香插在天公爐中。正殿的祭拜順序為先禮拜中央神龕的主祀神，再則禮拜左龕，然後禮拜右龕。祭拜時眼神應先目視神像，誠心誠意的向神明稟明祝禱的內容。