因於戰地政務時期下，馬祖為一戰地，為嚴密監控人口來往流動，確保馬祖防區，由連江縣政府訂定人口登記管制辦法，經由政務委員會核定實施，於1957年（民國46年）公告。根據《馬祖日報》民國46年11月6日報導指出，於辦法中規定的流動人口，包含的旅行人口與留宿人口，均須申請登記，規定嚴格。登記手續為台灣本島來往旅客（旅行人口）應繳驗國民身份證及台灣省入境證，本縣居民（留宿人口）應繳驗國民身份證及島嶼間出入境證。 流動人口登記期限為一個月，必要時得申請延期，最多2次。手續由地方村公所負責辦理，屬旅行人口者由村公所填寫流動人口登記聯單發給當事人收執備查。屬留宿人口者由村公所登記於留宿簿內。凡流動人口不依法申請登記或申報不實者，當事人及留居戶長均須依照受違警罰法之規定，予以處分。