媽祖神像，於拆除淡水海關碼頭D棟時發現，神像高39公分，長18.9公分，寬22.1公分，為木質坐姿神像。本文物的漆料已脫落得相當嚴重，僅餘少部分可資辨識，手部亦已損毀佚失。神像形制呈坐姿，坐於椅上，戴紅帽，黑面，閉眼，無鬚，身穿祥雲圖樣金色服裝，是女性神明，而黑面則與媽祖的形制相符。媽祖是漢人的海上神明，明代時於民間流傳已廣，清代政府以媽祖護祐清軍有功，於康熙22年（1683年）封媽祖為天后，並大力推廣媽祖信仰。本神像已入寶（入神）。一般而言，入寶是指製作神像時將虎頭蜂或雞冠血、硃砂、紙符等放入神像背後的小洞，以木塞堵住，然後是開光儀式，以硃砂點眼、唸咒。經過這些儀式後，神像就從凡物變成神明。