本工會於1948年1月13日成立，以保障勞工權益、增進知識技能、發展生展事業、改善勞工生活，並推行政府政令之實施及宣揚三民主義為宗旨。高雄縣市合併後，歷經改名、再經會員代表大會通過回復原名。會旗以黃色為基底，由楊國顯設計，於1983年10月製發，設計理念有三： 1. 三山係指鳳山、岡山、旗山三大市鎮為原高雄縣所轄區域之代表，其交叉並立有三山一體均衡發展、共存共榮之寓意。 2. 雙手指勞資雙方和諧共處、團結合作、平等互惠，另有勞動神聖、雙手萬能之象徵。 3. 齒輪係指全縣各界勞工在總工會領導之下，聯合一體、團結一心，其中十二道巨齒，隱指十二時辰，晝夜循環、周而復始、日新月異，自強不息之涵義。 另附有一更名後之高雄市總工會錦旗，旗幟上方為橘色「中華民國高雄市總工會」字樣，中間為手握板手，外圍有藍色齒輪與綠色桂冠葉圍繞，下方則為藍色字樣的本會英文名稱。